왓슨은 아시아의 과학 발전에도 의미 있는 역할을 했습니다. 2006년 쑤저우를 방문한 그는 이듬해 콜드 스프링 하버 연구소(CSHL)의 첫 해외 지부인 콜드 스프링 하버 아시아를 설립했습니다. 이후 이 연구소는 과학 교류를 위한 최고의 국제 플랫폼으로 자리매김하며, 아시아 지역 생명과학 연구 발전에 크게 기여했습니다. 특히 중국에 있어 왓슨의 지원은 오늘날까지도 그 영향력을 미치고 있습니다.

하지만 과학자든 그 누구든, 특히 전문 분야가 아닌 영역에서는 완벽할 수는 없습니다. 왓슨은 말년에 인류학, 지능, 성별, 인종과 관련된 여러 논란이 되는 발언을 했습니다. 집단 간 인지적 차이의 근본 원인이 유전적 차이일 수 있다는 그의 주장은 과학계에서 강한 비판을 받았습니다. 여성과 흑인에 대한 그의 일부 발언은 과학적 근거가 부족하고 해로운 고정관념을 조장한다는 이유로 널리 비난받았습니다. 이러한 발언들로 인해 결국 CSHL은 그의 명예 칭호를 박탈했습니다.